Con el objetivo de adquirir e incrementar la capacidad de análisis de Laboratorio de las secuencias del genoma de E. coli O157 autóctona, obtenidos mediante la utilización del secuenciador masivo MySeq de Illumnina, es que se contrató el servicio de
consultoría de Genese Molecular Consulting para acompañar al Laboratorio en las siguientes actividades:
- Diseño informático de hardware y software para una estación de trabajo bioinformática.
- Evaluación de las características de los datos a analizar y adecuar el tipo de hardware requerido.
- Desarrollo de un centro bioinformático propio.
- Asistencia en la descarga de bases de datos de secuencias de repositorios internacionales y paquetes bioinformaticos específicos.
- Capacitación en el uso de herramientas que respondan a las inquietudes del proyecto en relación al análisis de factores de toxicidad y virulencia.
- Evaluación de dominios proteicos conservados Islas genéticas de transferencia horizontal de factores de virulencia, entre otros.
- Asistencia en la planificación de ensayos bioinformáticas. Acompañamiento en la interacción con el personal del laboratorio para abordar la mejor estrategia bioinformatica.
- Asistencia rutinaria en el abordaje de problemas diarios de bioinformática. Asistencia en la interpretación de resultados y rediseño de estrategias bioinformáticas.
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